Depuis l'édition 2013, l’organisation des JRES est confiée au GIP RENATER (Réseau National de télécommunications pour la Technologie l‘Enseignement et la Recherche).

Les Journées Réseaux JRES étaient à l'origine organisées par le Réseau National de télécommunications pour la Technologie l‘Enseignement et la Recherche (RENATER), le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), le Comité Réseau des Universités (CRU) et la DSI de l'INRIA.